工程学院设有环境工程（吉林省一流本科专业建设点）、环境科学（吉林省一流本科专业建设点）、给水排水科学与工程、新能源科学与工程等4个本科专业（含环境工程ISEC），5个专业方向。学院基于“立德树人、以本为本”的教育理念，构建“2+0.5+1+0.5”卓越工程师人才培养模式，实施“工学结合、校企互动”的教学运行机制，形成了“重体系、强技能、塑价值”的人才培养特色。2025年，学院共计招生217人（新能源科学与工程专业拟于2026年开始招生）。

学院已培养近2000多名毕业生，学生就业率90%以上，考研率近30%。毕业生多数工作在一线和二线城市，主要从事环境研究、规划、设计、管理和评价等工作。多人考取了美国南加州大学、澳大利亚新南威尔士大学、爱尔兰都柏林大学、中国科学院大学、武汉大学、吉林大学等著名高校的研究生。

在近20年的办学实践中，我院办学定位和办学目标合理、教学中心地位稳定、师资力量雄厚、办学条件一流、教风严谨、学风优良，人才培养质量稳步提高。中国教育报、吉林日报、凤凰网等主流媒体多次报道我院人才培养改革工作。